Existen aún muchas lagunas en la investigación histórica sobre Fuente de Cantos, una población que ha carecido de tradición historiográfica, ya sea por la pobreza o por la tardía explotación de sus fuentes documentales (los archivos locales) y arqueológicas. No obstante, en los últimos años, historiadores locales y foráneos han publicado diversas monografías que nos permiten un acercamiento más seguro a ciertos períodos de su historia.

Entre ellos no está precisamente el de sus orígenes. Por vez primera, hasta lo que hoy sabemos, se documenta el topónimo "Fuente de Cantos" con ocasión de su conquista por los ejércitos cristianos hacia 1240. Al menos, así aparece en el Apuntamiento legal de Bernabé de Chaves escrito hacia 1740; hagamos constancia de que en nuestros archivos el primer documento que lo menciona es de 1293. Si damos crédito a Chaves (no hay razones para negárselo) ello significaría que la población ya existía antes de la conquista cristiana, aunque quizá con otra denominación.

Lo que sí se conoce perfectamente es que su actual término municipal estaba habitado desde la prehistoria. Gracias a los excelentes resultados de las excavaciones llevadas a efecto durante los últimos veinte años en los cerros conocidos como Castillejos I y Castillejos II, situados en las cercanías de la actual villa, se ha podido reconstruir con fidelidad el tránsito desde el Neolítico al período del dominio romano, momento en el cual estos asentamientos desaparecen o son desplazados por otros, bien por efecto de la conquista, bien por la necesidad de adaptarse a las necesidades de comunicación que impone el desarrollo que comienza a adquirir la Vía de la Plata, bien por el agotamiento y búsqueda de nuevos recursos económicos, entre los cuales se hallaría la minería.